重庆南开中学的体育、艺术、科技活动丰富多彩，成果突出。在各级体艺比赛中，学生获奖数百人次。女子篮球、田径、排球、足球、网球、乒乓球、跆拳道、国际象棋等运动队，在各种竞技中屡创佳绩。特别是学生女篮和田径队多次荣获全国冠军，代表中国参加世界大赛。艺术方面，合唱、民乐、管乐、舞蹈等团队有着很高的表演水平，多次获奖。科技活动丰富多彩，先后有40余人获得了重庆市青少年科技创新大赛一等奖，摘取了首届、第二届重庆市青少年科技创新市长奖、第三届中国青少年科技创新奖、“创意杯”全国中学生设计大赛团体第二名等。

　　2010年在哈萨克斯坦举行的第51届国际数学奥林匹克竞赛(IMO)上，高三学生赖力作为中国队队长，率领全队获得团体总分第一，并获得一枚个人金牌，成为重庆直辖后获得国际奥数金牌的第一人。

　　重庆南开体育方面成绩突出，其中2000年获重庆市传统项目学校篮球比赛（女子组）第一名，重庆市首届重点中学学生田径运动会团体总分第一名，2001年全国重点校女篮邀请赛第二名，2003年重庆市第一届运动会篮球比赛（青少年女子组）第一名，2006年8月重庆南开中学女子田径队代表重庆市，与来自20个省、自治区、直辖市代表队角逐，以三金、两银、一铜的优异成绩获得女子团体总分第一名。2007年在重庆市第十届中学生田径运动会中，校田径队初中组以206分超出第二名学校60分的绝对优势获得团体总分第一名，2007年在法国波尔多举行的世界中学生田径锦标赛上校田径队队员王艺颖同学获得亚军。

　　世界泛太平洋地区中学生运动会于2008年12月1日-6日在澳大利亚堪培拉举行。校田径队入选中国中学生国家队的四名参赛队员在田径比赛中再创辉煌，一人次获冠军，四人次获第三名，三人次获第四名。

　　重庆南开中学不只注重应试教育，也注重人能力的培养。从南开毕业后到大学深造的学子也发展不错，如清华大学致南开中学的喜报中就有：南开2003届毕业生李婧翌同学（就读清华大学生物系）、2004届毕业生毛献文同学（现就读清华大学化工系）荣获清华大学2005－2006学年综合一等奖学金，2004届毕业生王宇航同学（现就读清华大学土木工程系）、2004届毕业生邵玥同学（现就读清华大学航天航空学院）、2005届毕业生王晓同学（现就读清华大学电子系）、2005届毕业生何飞同学（现就读清华大学电子系）荣获清华大学2005－2006学年综合二等奖学金。2007年北京大学第二十九届学生代表大会中，高2005级毕业生沈冲同学高票当选为北京大学学生会办公室主任……还有不少同学也在其他大学荣获各种奖项。